МЦП подойдёт только для чистого клиента майнкрафта, если class файл в клиенте будет модифицирован модлоадерами, или прочими программами, то МЦП вам высыпет ошибки. В тоже время любой декомпилятор, в том числе JD-GUI не гарантирует вам 100% декомпиляцию продукта, и чем сложнее код, тем эта вероятность меньше(придётся побегать с бубном немного). К тому-же оракл сделали небольшую заподлянку любителям покрутить чужой код. С версии 1.4, или 1.5 нельзя включать в проект классы из jar файла, если они находятся в его корне, из-за чего использование JD-GUI для пересборки клиента майнкрафта бесполезно, разве что если собираетесь пересобрать Minecraft.class.
Короче, если автор темы собирается пилить дефолтный class файл майнкрафта, то тут ему поможет МЦП, иначе оооочень долгие танцы с бубном обеспечены.